Журнал стресс в биохимии и физиологии

Журнал стресс-физиологии и биохимии

Журнал стресс-физиологии и биохимии публикует экспериментальные, обзорные, методические статьи и гипотезы, связанные с физиологическим и биохимическим ответом растительного и животного организма на воздействие абиотических и биотических стрессовых факторов. Статьи по возможности должны быть понятны широкому кругу читателей; особое внимание необходимо уделить разделам Введение и Обсуждение, которые должны ясно привлекать внимание к новизне и значимости сообщаемых данных.

Журнал стресс-физиологии и биохимии обеспечивает быструю публикацию без сокращений оригинальных статей, описывающих результаты исследований, обзорных, методических статей и гипотез, связанных с физиологическим и биохимическим ответом растительного и животного организма на воздействие абиотических и биотических стрессовых факторов. Журнал отдает предпочтение статьям, которые заслуживают быстрой публикации в виду содержания в них оригинальных полученных данных широкого спектра биологической значимости.

Каждая статья направляется на рецензию, по меньшей мере, двум независимым рецензентам, отобранным редакционной коллегией и на основе их заключений принимается решение относительно опубликования, корректирования или отклонения статьи.

Представление статьи подразумевает что она сообщает неопубликованные нигде ранее данные, а также данные, которые в данный момент не находятся на рассмотрении для публикации где-либо еще. Журнал стресс-физиологии и биохимии оставляет за собой право публиковать материал, который уже был раннее опубликован (в электронном виде или ином виде). Если в статью включены ранее опубликованные таблицы, иллюстрации или более чем 200 слов текста, то должно быть получено письменное разрешение владельца авторского права. Копии таких писем с разрешение необходимо приложить к статье.

— Учреждение Российской академии наук Сибирский институт физиологии и биохимии растений Сибирского отделения Российской академии наук

readera.ru

Открытие кафедры физиологии растений и микробиологии состоялось в 1932 году и связано с именем выдающегося физиолога растений, заслуженного деятеля науки РСФСР и ТАССР, доктора биологических наук, профессора Алексея Михайловича Алексеева, который является основателем широко известной Казанской школы водного режима растений (школа А.М. Алексеева). Кафедра относится к числу старейших классических фундаментальных кафедр университета. В 1969 году от неѐ отделилась кафедра микробиологии. Основной профиль подготовки специалистов — экологическая физиология и биохимия растений. С 2001 года впервые среди университетов России начата подготовка специалистов по биотехнологии растений. В 2011 году кафедра переименована в кафедру физиологии и биохимии растений. Современной научной и учебной базой кафедры является Казанский институт биохимии и биофизики КазНЦ РАН, где студентами кафедры ежегодно выполняются курсовые и дипломные работы, многие выпускники поступают в аспирантуру института и продолжают там работать. Кафедра постоянно активно сотрудничает с другими академическими и отраслевыми учреждениями и вузами России — ТатНИИ сельского хозяйства РАСХН, Институтом природных систем и недропользования, Академией наук Республики Татарстан, Казанским аграрным университетом, МГУ, Пущинским научным центром, Институтом физиологии растений РАН (г. Москва) и др., а также с рядом зарубежных университетов (Финляндия, Германия, Бельгия, Польша).

История кафедры

Зарождение физиологии растений в Императорском Казанском университете относится к 70-м годам 19 столетия и связано с именем профессора Н.Ф. Леваковского. В это время в университете происходило формирование основных направлений по биологии. Специализированной кафедры физиологии растений ещ. не было, поэтому все физиологические работы были сосредоточены на кафедре ботаники. Н.Ф. Леваковский, исследуя взаимоотношения растений в природе, влияние внешних условий (влажности почвы, света, температуры) на морфологию, рост и развитие растений, положил начало экспериментальной морфологии и экологической физиологии растений.

Вместе с Н.Ф. Леваковским работали Е.Ф.Вотчал, который изучал механизмы передвижения воды по сосудистой системе растений, и В.А. Ротерт, впервые доказавший наличие у растений чувствительности и способности к ростовым движениям (фото- и геотропизм). Знаменательным событием стала защита в стенах Казанского университета крупнейшим физиологом растений М. С. Цветом в 1901 году магистерской диссертации «Физико-химическое строений хлорофильного зерна», в которой он описал разработанный им метод адсорбционной хроматографии, с помощью которого обнаружил и разделил два хлорофилла «а» и «б» и желтые пигменты. Это выдающиеся открытие в дальнейшем значительно ускорило изучение растительных пигментов и фотосинтеза и получило широчайшее применение в химии, биологии, медицине и различных отраслях промышленности. Лишь посмертно М.С. Цвет был признан подлинным основателем хроматографии (Сенченкова Е.М. «М.С. Цвет — создатель хроматографии», 1997). Основополагающее влияние на развитие физиологии растений в Казанском университете оказал В.В. Лепешкин, стоявший у истоков отечественной физико-химической биологии. За годы работы в университете в должности профессора кафедры ботаники и заведующего ботанической лабораторией (1910-1921 гг.) он обосновал учение о коллоидно-химическом строении протоплазмы растительных клеток, которое способствовало появлению нового физико-химического направления не только в физиологии растений, но и в других биологических науках. В силу сложившихся обстоятельств в 1921 году В.В. Лепешкин эмигрирует за границу, где по-прежнему в центре его внимания — коллоидное состояние тел как основа жизни, организм с точки зрения химии и физики и даже возможности искусственного создания протоплазмы (Kolloidchemische des Protoplasms.-Berlin: Springer, 1924. 228 s.). За свою плодотворную творческую деятельность за рубежом он получает заслуженное признание как одного из крупнейших представителей физико-химического направления в биологии.

Открытие в университете кафедры физиологии растений и микробиологии состоялось в 1932 году на базе Ботанической лаборатории. Бессменным заведующим кафедрой в течение почти 40 лет (1932-1971) был заслуженный деятель науки РСФСР и ТАССР, профессор Алексей Михайлович Алексеев, который прославился своими трудами в области водного режима растений. Он родился в Казани, в семье учителя. Среднее
образование получил в 3-й Казанской мужской гимназии, а высшее — в Казанском университете (1912-1917 гг.), закончив естественное отделение физико-математического факультета. Был оставлен профессорским стипендиатом и под руководством своего учителя профессора В.В. Лепешкина стал заниматься изучением осмотических свойств и проницаемости протоплазмы (1921-1925 гг.). Эти работы относятся к числу первых отечественных исследований физико-химических свойств растительных клеток. Именно огромным влиянием В.В. Лепешкина объясняется тот факт, что все научные труды А.М. Алексеева и его учеников базируется на физико-химическом подходе к изучению физиологических процессов.

Всю свою последующую многолетнюю творческую деятельность А.М. Алексеев посвятил разработке теоретических основ водного режима растений. Исследуя его связь с обменом веществ, продуктивностью растений и условиями среды, открыл ранее неизвестные физиологические закономерности действия засухи на растения («Физиологические основы влияния засухи на растения», 1938 г., докторская диссертация), что явилось важным вкладом в проблему засухоустойчивости растений. К приоритетным достижениям мирового уровня относится создание А.М. Алексеевым учения о термодинамике водного режима растений и введение в физиологию растений новых показателей энергетического состояния клеточной воды — активности и парциального химического потенциала. Концепцию физиологической роли термодинамических свойств воды А.М. Алексеев описал в своей знаменитой классической монографии «Водный режим растения и влияние на него засухи» (Казань, 1948), за которую ему была присуждена первая премия КГУ и медаль Всесоюзной с/х выставки (1955). Постоянно связывал результаты своих исследований с решением насущных задач практического растениеводства. Уже в 50-е годы в своих трудах в связи с часто повторяющимися засухами и большими потерями урожая он обращал внимание на необходимость организации в Татарстане системы орошаемого земледелия, что является в настоящее время одной из актуальных задач растениеводства РТ. Важным событием явилось освоение и применение аспирантом кафедры И.А. Тарчевским (научный руководитель — проф. А.М. Алексеев) нового метода меченых атомов — радиоактивного углерода для изучения влияния засухи на фотосинтетический метаболизм углерода (1956-1958 гг.). Это явилось прологом для открытия нового пути углеродного метаболизма С4 — фотосинтеза, сделанного на кафедре Ю.С. Карпиловым (1959-1960 гг.). За расшифровку биохимических реакций этого пути, спустя несколько лет, австралийские ученые Хетч и Слэк получили Нобелевскую премию. Однако первооткрывателем С4-фотосинтеза считается Ю. С. Карпилов.

В 60-е годы А.М. Алексеев обосновывает новое представление о водном режиме как важном ингредиенте обмена веществ и структуры протоплазмы растительных клеток и о необходимости более углубленного изучения водообмена растений на молекулярном уровне с помощью физических методов, прежде всего ЯМР. К этим работам подключились многие физики — В.Д. Корепанов, Н.А. Мальцев, Л.А. Абецедарская, В.Д. Федотов, впоследствии — В.Я. Волков, А.В. Анисимов, Г.А. Великанов и др., что привело к появлению нового биофизического направления в области водного обмена растений. А.М. Алексеевым подготовлено 3 доктора и более 20 кандидатов наук, опубликовано около 90 научных трудов, в том числе 3 монографии.

В 50-60-е годы сформировалась Казанская школа физиологов растений — исследователей водного режима растений, получившая широкую известность как школа профессора А.М. Алексеева и статус ведущей школы водного обмена растений в нашей стране. За время существования школы было подготовлено 11 докторов (из них 4 доктора по кафедре — И.Г. Сулейманов, И.А. Тарчевский, Л.П. Хохлова, О.А. Тимофеева) и более 100 кандидатов наук, опубликовано около 40 монографий и тематических сборников, сотни статей в отечественных и зарубежных изданиях. В настоящее время эта школа называется Казанской школой физиологов и биохимиков растений и ее возглавляет выпускник кафедры, академик РАН И.А. Тарчевский. Пройдя путь на кафедре от студента до профессора И.А. Тарчевский, был инициатором открытия кафедры биохимии (1965 г.) и ее заведующим, а впоследствии — директором Казанского института биологии КФ АН СССР (1975-1992 гг.). На этапе 70-80 годов учениками и последователями А.М. Алексеева — проф. И.Г. Сулеймановым, доц. Г.И. Пахомовой, проф. В.Е. Петровым, проф. Л.П. Хохловой, доц. С.Н. Черезовым на кафедре развивалось и углублялось традиционное для Казанской школы фитофизиологов направление — выяснение механизмов адаптации и устойчивости растений к экстремальным условиям окружающей среды с использованием новых методических подходов и современных методов — низкотемпературной и дифференциальной микрокалориметрии, ЯМР с импульсным градиентом магнитного поля, ИК — спектроскопии и др. Публикуется множество статей по фотоэнергетике, дыханию, водному обмену, химическому составу биосистем разной степени сложности — целые органы, клетки, органеллы (митохондрии и хлоропласты), мембраны, что позволило воссоздать наиболее целостную картину интеграции и регуляции физиологических процессов в системе целого растения в экстремальных условиях окружающей среды. Идеи и концепции А.М. Алексеева о состоянии и физиологической уникальности клеточной воды по- прежнему являются актуальными и значимыми не только для физиологии растений, но и для всей биологии клетки.

В 1988 году заведующим кафедрой проф. Л.П. Хохловой организуется первая научно-исследовательская лаборатория регуляторов роста и устойчивости растений (НИЛ РУР). В содружестве со многими учреждениями сельскохозяйственного профиля в лаборатории были развернуты работы по выяснению механизмов действия и практическому применению новых биологических и синтетических регуляторов роста в сельском хозяйстве, что способствовало активизации исследований по сельскохозяйственной физиологии и сближению с растениеводством.

В начале 90-х годов по инициативе проф. Л.П. Хохловой на кафедре возникло новое направление в мало разработанной области клеточной физиологии — физико-химическая организация цитоскелета и его роль в формировании термоадптивного потенциала растений. На основе результатов этих работ впервые обосновано представление о цитоскелете как важнейшей сенсорной структуре растительных клеток и разработана новая цитоскелетная диагностика стресс — устойчивости растений. Исследования проводилась по десяти грантам и по шести совместным международным проектам. Сотрудникам кафедры — Л.П. Хохловой, О.А. Тимофеевой, О.В. Олиневич была присуждена престижная именная премия Академии наук РТ имени В.А. Энгельгардта. По этому направлению защищена докторская (О.А. Тимофеева) и шесть кандидатских диссертаций.

С историей кафедры физиологии растений можно ознакомиться в книге проф. Л.П. Хохловой «Физиология растений в Казанском университете» (Казань, 2013 г.).

В настоящее время научные работы на кафедре ведутся в области клеточной, биохимической и молекулярной физиологии растений и посвящены выяснению в системе целого растительного организма роли мембран, синтеза стрессовых и рецепторных белков, экспрессии стресс-зависимых генов, поиску и идентификации молекулярных маркеров устойчивости растений к неблагоприятным условиям среды — низким и высоким температурам, водному дефициту, засухе, патогенам и тяжелым металлам. Используются современные методы и аппаратура: газометрия, ЯМР, иммунофлуоресценция, электрофорез, молекулярно-генетический анализ, адсорбционная спектрометрия, кондуктометрия и др.

kpfu.ru

Журнал стресс в биохимии и физиологии

Лаборатория биохимии стрессов микроорганизмов

Ключевые слова
бактерии в стрессовых условиях, некультивируемые бактерии, биохимия и физиология покоя у бактерий, микобактерии, латентный туберкулез, покоящееся формы возбудителя туберкулеза, антибактериальные вещества, транскриптомика и протеомика, стабильные РНК

Направления исследований

  • Изучение биохимических процессов адаптации бактерий к стрессовым условиям
  • Изучение биохимии и физиологии состояния покоя у бактерий (микобактерий)
  • Создание моделей латентного туберкулеза in vitro
  • Трнаскриптомный и протеомный анализ покоящихся форм микобактерий
  • Изучение механизмов образования и реактивации покоящихся и «некультивируемых» форм бактерий в связи с латентным туберкулезом
  • Поиск новых антибактериальных соединений активных против покоящихся форм
  • Разработка новых подходов к диагностике туберкулеза
  • Изучение немевалонатного пути биосинтеза изопреноидов у бактерий
  • Основные методы исследований
    В рамках проводимых в лаборатории исследований используются следующие методы:

  • культивирование бактерий в специальных условиях для получения покоящихся форм
  • характеристика бактериальных форм методами биохимии, флуоресцентной микроскопии и проточной цитометрии
  • создание молекулярных генно-инженерных конструкций для экспрессии целевых белков и получения мутантных клеток с гиперэкспрессией целевых белков
  • получение нокаутных штаммов микобактерий (в том числе М.tuberculosis) с помощью аллельного обмена
  • проведение транскриптомных (next generation) и протеомных исследований
  • скринирование новых антибактериальных (в том числе противотуберкулезных) соединений на моделях активных и покоящихся клеток

  • Краткая история лаборатории

    Лаборатория была создана в 1996 году на базе лаборатории Функциональной биохимии мембран, руководимой проф. Островским Д.Н. – известным российским биохимиком, специалистом в области мембран бактерий. В свою очередь, лаборатория, руководимая Д.Н. Островским была создана в 1981 году в результате реорганизации лаборатории Эволюционной биохимии, руководимой академиком А.И. Опариным — выдающимся российским ученым, автором теории происхождения жизни.

    Достижения

    ОСНОВНЫЕ ДОСТИЖЕНИЯ

    Лаборатория занимается исследованием молекулярных механизмов адаптации клеток бактерий к стрессовым условиям внешней среды. Наиболее интенсивные исследования проводятся в области изучения механизмов образования покоящихся и некультивируемых клеток микобактерий в ответ на неблагоприятные факторы внешней среды.

    Эти фундаментальные исследования имеют целью раскрытие механизмов латентного туберкулеза- заболевания, которому подвержена 1\3 населения Земли. В этой связи коллектив лаборатории создает оригинальные модели in vitro покоящихся клеток возбудителя туберкулеза, на которых проводятся исследования особенностей биохимии и физиологии у таких форм и при их реактивации в активные, размножающееся бактерии. В частности, особенное внимание уделяется изучению факторов инициации реактивации и стимуляции размножения покоящихся клеток. Разработанные модели используются также для тестирование новых антибактериальных (антитуберкулезных) соединений, способных убивать не только активные, но и покоящиеся формы.

    Лаборатория принимает участие в многочисленных исследовательских проектах совместно с другими отечественными лабораториями и международными партнерами. Партнерами Лаборатории являются: ИБХ РАН, Институт туберкулеза РАМН, МИТХТ.

    В лаборатории проводились научные исследования в рамках международных проектов Еврокомиссии FP6 и FP7.

    В лаборатории получены гранты по программе Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология», 7 грантов РФФИ и др. Коллектив опубликовал 46 статей за 2010-2015гг.

    В лаборатории постоянно ведется работа с молодежью и проводится работа по подготовке молодых специалистов. С 2000 года по тематике исследований были защищены 8 кандидатских диссертаций.

    За 2010-2015 годы получены следующие важные результаты :

    1. В области механизмов образования и характеристики покоящихся клеток бактерий

  • создана новая уникальная модель перехода активных клеток микобактерий (в том числе Mycobacterium tuberculosis) в покоящееся состояние
  • выявлен белок (гистоноподобный белок hlp), участвующий в образовании покоящихся форм микобактерий и обеспечивающий их стабильность
  • с помощью протеомного анализа выявлены белки с максимальной представленностью в покоящихся клетках M.tuberculosis
  • получены доказательства индукции покоящихся форм микобактерий под действием белка токсина модуля «токсин-антитоксин»
  • установлено, что покоящиеся формы микобактерий Mycobacterium smegmatis and Mycobacterium tuberculosis синтезируют красный пигмент, относящийся к порфиринам c внутриклеточной и внеклеточной локализацией. Возможно этот пигмент является одним из факторов стабилизации покоящихся клеток.
  • с помощью транскриптомного анализа обнаружено, что покоящиеся клетки M.tuberculosis сохраняют в достаточно большом количестве транскриптов, которые, возможно, являются запасенными для использования в начальной стадии реактивации покоящихся клеток. В этих же клетках обнаружено наличие некодирующих РНК, включая антисмысловые транскрипты и малые межгенные РНК. Поскольку эти РНК практически не представлены в транскриптомe активных клеток, можно полагать, что они выполняют пока не известные специфические функции в условиях латентного туберкулеза.
  • 2. В области изучения механизмов реактивации покоящихся клеток микобактерий

  • обнаружены новые низкомолекулярные факторы реактивации микобактерий из покоящегося состояния.
    Найдено, что непредельные свободные жирные кислоты, добавленные к бактериальным клеткам в микромолярных концентрациях, способны стимулировать переход покоящихся и «некультивируемых» клеток M.smegmatis и M.tuberculosis в активное состояние. Предполагается, что жирные кислоты в организме могут быть важным фактором реактивации латентного туберкулеза.
  • получены доказательства участия аденилатциклазы в реактивации покоящихся клеток микобактерий под действием свободных жирных кислот.
  • обнаружено, что фрагменты бактериальной клеточной стенки и муропептиды являются сигнальными молекулами для стимуляции реактивации покоящихся клеток микобактерий
  • продемонстрирована важность белка RipA — L, D-эндопептидазы, взаимодействующей с белком Rpf для реактивации покоящихся форм микобактерий.
  • сформулирована гипотеза о трехстадийном процессе реактивации покоящихся клеток микобактерий.
  • 3. В области поиска и изучения новых антибактериальных средств

    www.fbras.ru

    Авторизация на сайте

    Генгин Михаил Трофимович

    Генгин Михаил Трофимович (родился 1. 8. 1941 г., с. Елизино Мокшананский р-н) — доктор биологических наук, профессор. Почетный работник высшего профессионального образования РФ, член-корреспондент Международной Академии наук педагогического образования, гранд-доктор философии, full-профессор Европейской Академии Информатизации, действительный член Нью-Йоркской Академии наук. Руководитель Пензенского отделения Российского Нейрохимического общества.

    Окончил Днепропетровский госуниверситет в 1969 году, специальность «Биохимия». 1972-73 гг. – ассистент, 1974-75 гг. – старший преподаватель, 1976-87 гг. – доцент кафедры биохимии и биофизики Днепропетровского госуниверситета. 1988-89 гг. – доцент; 1989-2006 гг. – заведующий кафедрой химии и биохимии; с 2006 г. по 2014 г. – заведующий кафедрой биохимии Пензенского государственного университета. С 2014 г. по настоящее время — профессор кафедры, главный научный сотрудник НИИ ФиПИ ПГУ. Автор около четырёх сотен научных работ.

    В 1993 году открыл обучение по специальности «химия-биология».

    В 2001 организовал и возглавил научно-методич. центр «Малая Академия естественных наук».

    С 2001 г. по 2005 г. — проректор по научной работе ПГПУ.

    В 2002 открыл новую специальность «биохимия». Организовал и руководит в Пензе отделением Всероссийского обществава нейрохимиков. В 2002 основал научный журнал «Вестник молодых ученых ПГПУ им. В. Г. Белинского». Член оргкомитетов Всероссийских и региональных конференций, участник многих международных, Всероссийских съездов, конференций.

    Область научных интересов: биохимия мозга, энзимология, химия и биохимия регуляторных пептидов, химия и биохимия протеолитических ферментов, молекулярные механизмы и биохимия нейрологических заболеваний, биохимические и молекулярные механизмы стресса, функциональная нейрохимия, проблемы химического образования. Опубликованы 12 учебных пособий, в т.ч. с грифом МО РФ, 145 научных статей в международны и российских академических научных журналах («Biochemie», «Украинский биохимический журнал», «Биохимия», «Нейрохимия», «Физиологический журнал» и др.).

    dep_bio.pnzgu.ru

    Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН

    Connected to:

    Материал из Википедии — свободной энциклопедии

    Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН — один из институтов Иркутского научного центра Сибирского Отделения Академии Наук. Расположен в Иркутске.

    Общие сведения

    Основными направлениями научной деятельности института являются проблемы физиологии и биохимии растений, микробиологии и почвоведения, энтомологии, ботаники, геоботаники и лесоведения, биология развития и эволюция живых систем, экспрессия генетической информации в клетке, физиолого-экологические проблемы биоразнообразия растений. [2]

    Институт был основан в 1961 году на базе Отдела биологии при Восточно-Сибирском филиале АН СССР под названием Восточно-Сибирский биологический институт СО АН СССР. Нынешнее название институт получил в декабре 1966 года после своей реорганизации. [3]

    Директором-организатором и основателем института был (1950—1976 гг.) был член-корреспондент АН СССР Фёдор Эдуардович Реймерс. В те годы в состав института численностью 112 человек (в том числе 3 доктора и 17 кандидатов наук) входило 6 лабораторий и экспериментальная база. Институт возглавляли следующие директора: [3]

    В состав института входят следующие научные подразделения: [4]

  • Отдел Клеточной биологии и инженерии
    • Лаборатория Генетической инженерии растений (Заведующий лабораторией — Константинов Ю. М., доктор биологических наук, профессор) [5]
    • Лаборатория Физиологии растительной клетки [6]
    • Лаборатория Физиологии трансгенных растений
    • Лаборатория Физико-химических методов исследования
    • Отдел Устойчивости растений к стрессам
      • Лаборатория Физиологической генетики растений (руководителями были чл.-корр. АН СССР Ф.Э. Реймерс, затем, с 1975 г. по 1980 г. — д.б.н. Э.Е. Хавкин; с 1981 года д.б.н., профессор В.К. Войников) [7]
      • Лаборатория физиолого-биохимической адаптации
      • Лаборатория физиологии устойчивости растений
      • Лаборатория фитоиммунологии
      • Отдел Устойчивости наземных экосистем
        • Лаборатория Энтомопатологии древесных растений (Заведующая лабораторией — д.б.н. Михайлова Татьяна Алексеевна,) [8]
        • Лаборатория Биоиндикации экосистем
        • Лаборатория Агроэкологии
        • Лаборатория Физиологии продуктивности растений
        • Группа Гербарий
        • Группа Оранжерея
      • Научно-технический отдел
        • Директор — Войников Виктор Кириллович, профессор, доктор биологических наук [9]
        • Зам. директора по научной работе:
          • Боровский Геннадий Борисович, профессор, доктор биологических наук
          • Воронин Виктор Иванович, доктор биологических наук
          • Советник РАН
            • Саляев, Рюрик Константинович, член-корреспондент РАН, профессор, доктор биологических наук
            • Институтом издаётся научный журнал:

              • Журнал стресс-физиологии и биохимии (основан в 2005 году, выходит один номер в год) [10]
              • www.wikiwand.com